WISS bedient die Verbindung von Berlin nach Basel weiterhin dreimal täglich: morgens, nachmittags und abends. Es ändert sich lediglich der Abflughafen von Tempelhof zu Tegel; Flugnummern sowie Abflugzeiten bleiben gleich.
Nach Zürich hebt SWISS ebenfalls wie bisher dreimal täglich ab und bietet optimale Anbindungen nach Bangkok, Hongkong, Singapur, Los Angeles, Miami, New York, Johannesburg und Tel Aviv. Ein Vorteil für SWISS-Passagiere sind die kurzen Umsteigezeiten in Zürich. Zudem kommen Fluggäste in den Genuss des neuen Airside Centers, das Mitte September 2004 im Transferbereich des Terminal 1 eröffnet wurde. Auf 150.000 m² finden sich 60 Geschäfte und Restaurants, die während eines Aufenthalts am Züricher Flughafen zum Bummeln und Verweilen einladen. Verkürzt wurden mit der Eröffnung des neuen Airside Centers auch die Wege zu allen Abflugbereichen.